Video: BAM indeks fayli nima?
2024 Muallif: Lynn Donovan | [email protected]. Oxirgi o'zgartirilgan: 2023-12-15 23:54
A BAM fayli (. bam ) SAM ning ikkilik versiyasidir fayl . SAM fayl (. sam) yorliq bilan ajratilgan matn fayl ketma-ketlikni moslashtirish ma'lumotlarini o'z ichiga oladi. Indekslash : IGV talab qiladi, ham SAM va BAM fayllari joylashuvi bo'yicha saralanadi va indekslangan , va bu indeks fayllari ma'lum bir nomlash qoidalariga rioya qiling.
Xuddi shunday, odamlar BAM faylini qanday ochishim mumkinligini so'rashadi.
Dan Fayl menyu tanlash Ochiq va tanlang BAM fayllari chap tomondan. O'ng tarafdagi "Qo'shish" tugmasini bosing BAM fayli . ga o'ting BAM Sinov Fayllar siz yuklab olgan papkani tanlang with_index_with_graph. bosing Ochiq , xaritani tanlang.
Ikkinchidan, BAM faylini Fastq-ga qanday o'zgartiraman? Quyida BAM faylini FASTQ formatiga aylantirish bosqichlari keltirilgan. Bu Linuxda ishlaydi va SAMTOOLS va BEDTOOLS talab qiladi
- SAMTOOLS-ni yuklab oling.
- Buyruq tar xzvf samtools-version.tar.bz2 dan foydalanib chiqarib oling.
- U samtools-version nomli papkani yaratadi.
- CD samtools-versiya katalogiga o'ting.
Xuddi shunday, qanday qilib BAM faylini SAM fayliga aylantiraman?
Kimga SAMni aylantiring uchun BAM , biz samtools view buyrug'idan foydalanamiz. Biz kiritishimiz kiritilganligini ko'rsatishimiz kerak SAM formati (sukut bo'yicha u kutadi BAM ) -S opsiyasi yordamida. Bundan tashqari, biz chiqishni xohlayotganimizni aytishimiz kerak BAM (sukut bo'yicha u ishlab chiqaradi BAM ) -b varianti bilan.
Samtools view nima qiladi?
Samtools BAM formatida tekislashni manipulyatsiya qiluvchi yordamchi dasturlar to'plamidir. U SAM (Sequence Alignment/Map) formatidan import qiladi va unga eksport qiladi, qiladi saralash, birlashtirish va indeksatsiya qilish va istalgan mintaqadagi o'qishlarni tezda olish imkonini beradi. Samtools oqim ustida ishlash uchun mo'ljallangan.
Tavsiya:
PFX fayli bilan nima qilishim kerak?
Pfx fayli PFX formatida eksport qilinadigan tizim sertifikati va shaxsiy kalitning birikmasidir. Fayl vCenter Server tizimidagi pastki katalogga ko'chiriladi. Shaxsiy ma'lumotlar almashinuvi formati (PFX) sertifikatlar va ularning shaxsiy kalitlarini bir kompyuterdan ikkinchisiga yoki olinadigan muhitga o'tkazish imkonini beradi
Test fayli nima?
TEST fayli nima? TEST fayl turi asosan Apple II operatsion tizimi bilan bog'langan
C++ da tasodifiy kirish fayli nima?
C tilida faylga tasodifiy kirish Oldingi darslarda biz faylni ochish, faylni yopish, fayldan o'qish va faylga yozishni o'rgangan edik. Shuningdek, biz fayllarning ikki turi, ikkilik fayllar va matnli fayllar mavjudligini bilib oldik. Tasodifiy faylga kirish fayl ko'rsatgichini o'qish yoki yozish uchun faylning istalgan qismiga olib borishni bildiradi
SQL Serverda ommaviy ish fayli nima?
Ommaviy ish fayli - bu kompyuter operatsion tizimi uchun buyruqlar ketma-ketligini o'z ichiga olgan matnli fayl. Siz ommaviy ish faylidagi buyruqlar ketma-ketligini buyruq satrida ommaviy ish faylining nomini kiritish orqali boshlaysiz
SQLda indeks va indeks yaratish nima?
SQL CREATE INDEX bayonoti. CREATE INDEX operatori jadvallarda indekslar yaratish uchun ishlatiladi. Indekslar ma'lumotlar bazasidan ma'lumotlarni tezroq olish uchun ishlatiladi. Eslatma: Jadvalni indekslarsiz yangilash jadvalni yangilashdan ko'ra ko'proq vaqt talab etadi (chunki indekslar ham yangilanishni talab qiladi)